Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc61Q3UJV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc61Q3UJV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.2 ms