Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr55Q3UJF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms