Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp19Q3UJD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp19Q3UJD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp19Q3UJD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms