Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3UJC8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Q3UJC8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UJC8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UJC8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UJC8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Q3UJC8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UJC8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UJC8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UJC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UJC8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UJC8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UJC8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UJC8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms