Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnep1r1Q3UJ81 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms