Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc34Q3UI66 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms