Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mier3Q3UHF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mier3Q3UHF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mier3Q3UHF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms