Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nom1Q3UFM5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nom1Q3UFM5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms