Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd8Q3UFK8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmd8Q3UFK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms