Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip13Q3UA06 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trip13Q3UA06 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip13Q3UA06 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms