Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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Rnf180Q3U827 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf180Q3U827 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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