Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmf1Q3U3R4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmf1Q3U3R4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms