Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palb2Q3U0P1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palb2Q3U0P1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms