Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc9Q3U0M1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms