Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd33bQ3U0L2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd33bQ3U0L2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd33bQ3U0L2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms