Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp13a5Q3TYU2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp13a5Q3TYU2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms