Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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