Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21440Q3TTD8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms