Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc13Q3TIR1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179 ms