Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2bQ3TD49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2bQ3TD49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms