Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hddc2Q3SXD3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hddc2Q3SXD3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms