Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sap25Q1EHW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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