Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptcd3Q14C51 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptcd3Q14C51 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptcd3Q14C51 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptcd3Q14C51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptcd3Q14C51 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptcd3Q14C51 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptcd3Q14C51 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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