Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ptchd1Q14B62 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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ptchd1Q14B62 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ptchd1Q14B62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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