Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpusd2Q149F1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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