Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc162pQ0VG85 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms