Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd12Q0VE29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd12Q0VE29 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd12Q0VE29 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms