Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt80Q0VBK2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt80Q0VBK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt80Q0VBK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms