Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem52bQ0VBF2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem52bQ0VBF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem52bQ0VBF2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms