Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab42Q0PD08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms