Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5Y3

Tppp2, Tubulin polymerization-promoting protein family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tppp2Q0P5Y3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tppp2Q0P5Y3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tppp2Q0P5Y3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tppp2Q0P5Y3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tppp2Q0P5Y3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms