Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurl1bQ0MW30 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Neurl1bQ0MW30 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurl1bQ0MW30 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurl1bQ0MW30 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurl1bQ0MW30 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurl1bQ0MW30 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurl1bQ0MW30 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurl1bQ0MW30 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms