Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q08AU9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q08AU9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q08AU9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q08AU9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q08AU9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q08AU9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q08AU9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q08AU9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q08AU9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q08AU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q08AU9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q08AU9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q08AU9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms