Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff1Q08423 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms