Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51Q08297 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51Q08297 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51Q08297 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51Q08297 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad51Q08297 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51Q08297 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms