Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx4Q07424 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms