Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2Q07279 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfe2Q07279 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2Q07279 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2Q07279 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfe2Q07279 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms