Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gdf3Q07104 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms