Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1bQ06985 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Siah1bQ06985 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms