Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox4Q06831 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox4Q06831 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms