Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp2Q06649 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp2Q06649 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp2Q06649 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms