Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms