Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hspg2Q05793 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms