Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk7Q03147 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk7Q03147 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms