Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfiaQ02780 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfiaQ02780 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms