Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnb1Q02248 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnb1Q02248 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnb1Q02248 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms