Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PrkcqQ02111 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PrkcqQ02111 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms