Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd1Q01822 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd1Q01822 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd1Q01822 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms