Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mc1rQ01727 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mc1rQ01727 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms