Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmgcrQ01237 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms